Microarray, RNA-Seq atau Exome? Memilih Kaedah Genomik Mengikut Persoalan Penyelidikan di bawah JRP 1.0
Di bawah JRP 1.0 Prima Nexus Joint Research Program, tiga perkhidmatan genomik boleh disokong melalui pembiayaan in-kind. Pilihan yang sesuai bergantung pada persoalan penyelidikan, dan setiap projek yang diluluskan bermula dengan konsultasi Lead Genomic Scientist mengenai pilihan tersebut.
· Pembiayaan penyelidikan
Permohonan JRP 1.0 dibuka sehingga 30 Disember 2026. Lihat perkhidmatan dan pembiayaan in-kind.
KUALA LUMPUR, 2 November 2026: Prima Nexus telah menyediakan panduan ringkas untuk penyelidik yang sedang memilih kaedah genomik untuk dicadangkan di bawah JRP 1.0, fasa pertama Prima Nexus Joint Research Program. Tiga perkhidmatan boleh disokong dengan pembiayaan in-kind: human genotyping microarray, penjujukan mRNA dan penjujukan exome keseluruhan manusia. Pilihan yang tepat bergantung pada apa yang ingin diketahui oleh kajian.
Mulakan dengan persoalan
Halaman Genomics meringkaskan pilihan dalam satu panduan mudah: varian diketahui pada ramai orang, pilih microarray; varian baharu atau jarang, pilih penjujukan; ekspresi gen secara menyeluruh, pilih RNA-seq; beberapa gen sahaja, pilih real-time PCR. JRP 1.0 menyokong tiga jenis kajian pertama melalui perkhidmatan yang dibiayainya.
Human genotyping microarray: varian diketahui pada ramai orang
Illumina Infinium Global Screening Array membaca kira-kira 654,000 varian diketahui merentasi genom dalam satu larian, pada kos setiap sampel yang sesuai untuk kajian kohort. Ia sesuai untuk persoalan farmakogenomik, nenek moyang dan populasi, dan imputasi boleh memanjangkannya kepada berjuta-juta varian. Ia hanya menerima sampel manusia, dan membaca panel tetap varian diketahui, bukan keseluruhan jujukan.
Sampel boleh berupa air liur, darah penuh, tisu segar atau beku, pelet sel atau swab bukal, dengan DNA diekstrak untuk anda, atau DNA genomik sekurang-kurangnya 200 ng.
Penjujukan exome keseluruhan manusia: varian jarang dan baharu dalam gen
Penjujukan exome keseluruhan membaca setiap bes gen pengekod protein, tempat kebanyakan varian penyakit diketahui berada, pada liputan purata kira-kira 100x. Ia sesuai untuk penyakit jarang, keadaan diwarisi dan pencarian varian baharu dalam gen, contohnya dalam sesebuah keluarga. Ia memerlukan DNA genomik manusia yang ditulenkan sekurang-kurangnya 100 ng, dan sampel berharga atau berkuantiti rendah sehingga kira-kira 10 ng.
Ia hanya membaca gen pengekod protein, kira-kira 1 hingga 2% daripada genom. Apabila variasi di luar gen penting, penjujukan genom keseluruhan ialah kaedahnya, ditawarkan sebagai perkhidmatan di halaman Genomics.
Penjujukan mRNA: gen mana yang dihidupkan atau dimatikan
Penjujukan mRNA mengukur setiap gen yang diekspresikan dan tahap kekuatannya, dalam mana-mana spesies, untuk menunjukkan laluan di sebalik sesuatu keadaan, rawatan atau perubahan persekitaran. Perkhidmatan standard ialah stranded mRNA sequencing pada 6 Gb setiap sampel, daripada RNA tulen sekurang-kurangnya 0.2 µg dengan RIN 7 atau lebih.
Perbandingan antara kumpulan memerlukan sekurang-kurangnya tiga replikasi biologi bagi setiap kumpulan, jadi reka bentuk kajian mesti dimuktamadkan sebelum sampel dikumpulkan. Di bawah JRP 1.0, kajian bukan manusia layak jika berkait dengan kesihatan manusia atau genomik populasi: kajian mikrobiom usus tentang kesihatan manusia layak, manakala kajian mikrob yang menguraikan plastik tidak layak.
Tidak pasti? Konsultasi membantu anda memutuskannya
Setiap projek JRP 1.0 yang diluluskan diselaraskan bersama Lead Genomic Scientist sebelum penjanaan data bermula, dan Prima Nexus menyediakan cadangan penuh bagi setiap projek yang dikendalikannya, menggariskan kaedah, sampel dan analisis sebelum sebarang kerja bermula. Sokongan bioinformatik lanjutan boleh membawa analisis lebih jauh. Setiap satu daripada tiga perkhidmatan ini mengambil masa kira-kira 6 hingga 8 minggu daripada sampel yang lulus pemeriksaan kualiti.
Persoalan penyelidikan yang jelas sudah memadai untuk memohon. Kajian yang dibangunkan sepenuhnya, sampel yang siap atau kelulusan etika tidak diperlukan pada peringkat ini; jika kelulusan etika diperlukan, ia mesti ada sebelum sampel diproses. Permohonan mengambil masa kira-kira sepuluh minit dan ditutup pada 30 Disember 2026.
Tentang Prima Nexus
Ditubuhkan pada 2014, Prima Nexus Sdn Bhd ialah syarikat penyelidikan, perundingan saintifik dan sokongan penyelidikan bersepadu dari Malaysia yang memajukan penemuan saintifik dan inovasi penjagaan kesihatan. Kami menyediakan penyelesaian penyelidikan menyeluruh, daripada penemuan peringkat awal dan reka bentuk eksperimen kepada kajian berasaskan sel, ujian haiwan praklinikal, ujian klinikal dan pengkomersialan. Kepakaran pelbagai disiplin kami merangkumi genomik, aplikasi genetik, proteomik, biologi molekul, penyelidikan sel stem, bioinformatik dan penyelidikan klinikal. Melalui kerjasama strategik dengan universiti, institusi penyelidikan, industri dan rakan teknologi global, kami menghubungkan kepakaran saintifik dan teknologi canggih untuk mempercepat penyelidikan menjadi aplikasi dunia sebenar. Kerjasama kami telah menyokong lebih 150 makalah dalam jurnal ulasan rakan sebaya dan pasukan penyelidik di lebih 40 institusi di seluruh Malaysia. Lebih lanjut tentang Prima Nexus.
Pertanyaan media dan perkongsian
Prima Nexus Sdn Bhd, Level 2, Mercu Aspire, 59200 KL Eco City, Kuala Lumpur, Malaysia. E-mel info@primanexus.com.my atau WhatsApp 017-305 1076.
